News
Feedback RegressionGeschrieben am 12.07.24 von Maximilian Bähr Liebe Bioinformatik Studierende, das Feedback für die Abgabe eurer Regression ist nun sichtbar, bitte beachtet, dass die Deadline für die Resubmission des Regressors ebenfalls Montag, der 15.07 16:00 ist. -Eure Tutoren |
Vorstellung der Challenge-ErgebnisseGeschrieben am 11.07.24 von Ana Shikhiashvili Liebe Studierende, die Vortragsrunde, in der ihr eure Ergebnisse der Challenge präsentiert, wird nächste Woche Dienstag (16.07.) in der Vorlesung (14 Uhr) stattfinden. Die Teilnahme ist verpflichtend und Voraussetzung zum Bestehen der Challenge. Im Vortrag sollt ihr in 5-10 Minuten eure… Weiterlesen Liebe Studierende, die Vortragsrunde, in der ihr eure Ergebnisse der Challenge präsentiert, wird nächste Woche Dienstag (16.07.) in der Vorlesung (14 Uhr) stattfinden. Die Teilnahme ist verpflichtend und Voraussetzung zum Bestehen der Challenge. Im Vortrag sollt ihr in 5-10 Minuten eure Herangehensweise an die Challenge (verwendete Modelle, Hyperparameter, Sampling-Methoden, ...) sowie eure Resultate auf den zehn Beispielmedikamenten vorstellen. Anschließend werden die Challenge-Gewinner bekannt gegeben.
Viele Grüße, Euer Bioinformatik 2 Team
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Uhrzeit NachklausurGeschrieben am 09.07.24 von Ana Shikhiashvili Liebe Studierende, die Nachklausur wird am 08.10 um 14:00 Uhr stattfinden. -Euer Bioinformatik 2 Team. |
Klarstellung ResubmitGeschrieben am 09.07.24 von Maximilian Bähr Liebe Bioinfromatik Studierende, bitte beachtet, dass der Resubmit lediglich zur Behebung eurer Fehler dient, allerdings nicht um ein neues (besseres) Modell zu verwenden oder ähnliche Verbesserungen vorzunehmen. -Eure Tutoren |
Feedback KlassifikationGeschrieben am 08.07.24 (letzte Änderung am 08.07.24) von Maximilian Bähr Liebe Bioinformatik studierende, eine vorab version eures Feedbacks für die Klassifikations Challenge ist jetzt online. Wir haben dort eure Fehler grob beschrieben, später im Tutorium gibt es Folien mit genaueren Erklärungen. Ebenfalls ist die Abgabe für eure Resubmission geöffnet. Bitte… Weiterlesen Liebe Bioinformatik studierende, eine vorab version eures Feedbacks für die Klassifikations Challenge ist jetzt online. Wir haben dort eure Fehler grob beschrieben, später im Tutorium gibt es Folien mit genaueren Erklärungen. Ebenfalls ist die Abgabe für eure Resubmission geöffnet. Bitte beachtet, dass die Deadline für die Resubmission: Montag, den 15. Juli 16:00! Bei Fragen, kommt bitte in das Tutorium heute oder nutzt das Forum! |
Termin Nachklausur (08.10)Geschrieben am 05.07.24 von Maximilian Bähr Liebe Bioinformatik Studierende, der Termin für die Nachklausur wird auf den 08.10 fallen. Gruß, euer Bioinformatik 2 Team |
No lecture tomorrow (02.07.2024)Geschrieben am 01.07.24 von Andrea Volkamer Dear all, please excuse the short notice, but due to illness I need to cancel tomorrows (Tuesday, 2.7.2024) lecture. See you all again on Thursday, 4.7.2024. Best regards, Andrea Volkamer |
KlausurterminGeschrieben am 20.06.24 von Ana Shikhiashvili Liebe Studierende, die Klausur findet am 23.07.2024 um 14:00 in E2.1, Raum 007 statt. Die Anmeldung in LSF ist bereits freigeschaltet und die An- und Abmeldefrist endet am 16.07.2024. Weitere Details zur Klausur werden in den nächsten Wochen folgen. Liebe Grüße,
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Ersatz für Tutorium am DienstagGeschrieben am 19.05.24 von Maximilian Bähr Liebe Bioinformatik Studierende, da am Montag Feriertag ist entfällt auch das Tutorium, und auch die Office Hour am Freitag wird euch nichts für das aktuelle Blatt helfen, da die Abgabe ja am Donnerstag ist.
Wir haben und also dazu entschlossen am Dienstag um 16:00 eine Office Hour… Weiterlesen Liebe Bioinformatik Studierende, da am Montag Feriertag ist entfällt auch das Tutorium, und auch die Office Hour am Freitag wird euch nichts für das aktuelle Blatt helfen, da die Abgabe ja am Donnerstag ist.
Wir haben und also dazu entschlossen am Dienstag um 16:00 eine Office Hour anzubieten.
Liebe Grüße, eure Tutoren. |
Erstes Übungsblatt und AbgabeteamsGeschrieben am 18.04.24 von Katharina Buchthal Liebe Bioinformatik Studierende, das erste Übungsblatt ist nun hochgeladen. Noch eine kleine Erinnerung: ihr habt noch bis heute (23:59 Uhr) Zeit, Abgabeteams (aus zwei Personen) im CMS zu erstellen (Persönliche Statusseite).
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Bioinformatik 2
Diese Veranstaltung schließt an die Bioinformatik I Vorlesung an und wird ebenfalls in Deutsch gehalten. Während in der Bioinformatik I der Schwerpunkt auf sequenzbasierten Bioinformatikmethoden liegt, fokussiert sich die Bioinformatik 2 Vorlesung auf die bioinformatische Theorie und Praxis von molekularen Strukturen und Interaktionen. Mit unter zu den Themen gehören:
- Strukturen von Proteinen
- Zuweisung und Vorhersage von Sekundärstrukturen
- Deep Learning
- Homologie Modellierung
- Molekulares Docking
Vorkenntnisse
- Mathematik für Informatiker I - II
- Biostatslab
- Programmierung II
- Bioinformatik I
- C++-Programmierung unter Linux
Vorlesungen
Dienstag, 14:15-16:00, Gebäude E2.1, Hörsaal 007
Donnerstag, 14:15-16:00, Gebäude E2.1, Hörsaal 007
Die erste Vorlesung Dienstag findet am Dienstag den 16.04 statt.
Tutorien
Montag, 16:15-17:45, Gebäude E2.1, tba
Voraussetzung zur Scheinvergabe
- Erfolgreiches Bearbeiten der Übungen
- 50% Theoriepunkte
- 50% Praxispunkte
- Bestehen der Klausur