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KlausurterminGeschrieben am 12.01.26 von Sven Rahmann Hallo, leider ergibt die Umfrage zur Klausur eine Partition in 2 disjunkte Gruppen. Es wäre vielleicht gut, nicht nur die präferierten Termine anzugeben, sondern ALLE Termine, an denen die Klausur möglich ist, da ich auf jeden Fall einen der genannten Termine nehmen werde. Bisher ist das Montag… Weiterlesen Hallo, leider ergibt die Umfrage zur Klausur eine Partition in 2 disjunkte Gruppen. Es wäre vielleicht gut, nicht nur die präferierten Termine anzugeben, sondern ALLE Termine, an denen die Klausur möglich ist, da ich auf jeden Fall einen der genannten Termine nehmen werde. Bisher ist das Montag 23.02., 12-15 Uhr, sofern sich ein Raum findet. Das Problem ist, dass das die BioStatsLab Klausur am folgenden Tag stattfindet. |
Klausurtermin-Umfrage // Übungsblatt 09 // Vorlesungsvideo nächste WocheGeschrieben am 09.01.26 von Sven Rahmann Hallo, es gibt eine Umfrage zum Klausurtermin (bei den Materialien, ganz oben); bitte füllt die so bald wie möglich aus. Wir haben auch Assignment 09 zur RNA-Bioinformatik veröffentlicht. Deadline ist Montag 19.01. Es wird auch noch #10 (deadline 26.01.) und #11 (deadline 02.02.) geben, aber… Weiterlesen Hallo, es gibt eine Umfrage zum Klausurtermin (bei den Materialien, ganz oben); bitte füllt die so bald wie möglich aus. Wir haben auch Assignment 09 zur RNA-Bioinformatik veröffentlicht. Deadline ist Montag 19.01. Es wird auch noch #10 (deadline 26.01.) und #11 (deadline 02.02.) geben, aber sonst keine mehr; bitte beachtet das beim Vorstellen eurer Löstungen. In der nächsten Woche werden keine Vor-Ort-Vorlesungen und auch keine Tutorien stattfinden, weil die Gruppe auf einer Konferenz in Kanada ist. Es wird statt dessen ein Video zum Download/Anschauen geben. Assignment 10 wird sich dann darauf beziehen. Fragen dazu können dann in der übernächsten Woche ab 19.01. gestellt werden. - Sven Rahmann |
Submission open for Assignment 08Geschrieben am 09.01.26 von Johanna Schmitz Dear all, |
Cancellation of another lecture today (18.12.)Geschrieben am 18.12.25 von Sven Rahmann Unfortunately, I am now really sick and will not be able to work at least for today and tomorrow. Have a great holiday season and see you again next year! |
Cancellation of lecture today 16.12.2025Geschrieben am 16.12.25 von Sven Rahmann Unfortunately I have to cancel today's lecture due to sickness. Please use the time to look at the Snakemake assignment. |
Overlap graph greedyGeschrieben am 26.11.25 von Johanna Schmitz Hallo zusammen, wie auch schon eben in der Übung besprochen, gibt es verschiedene Greedy Heuristiken um die Knoten zu verbinden. Hallo zusammen, wie auch schon eben in der Übung besprochen, gibt es verschiedene Greedy Heuristiken um die Knoten zu verbinden. |
Assignment 05Geschrieben am 26.11.25 von Sven Rahmann Viel Spass mit Assignment 05 (suffix trees, arrays, bwt)! |
Programmieraufgaben + Office HourGeschrieben am 25.11.25 von Johanna Schmitz Hallo zusammen, bitte gebt die Programmieraufgaben in Python ab. |
Übungsblatt 4 + Korrekturen auf Blatt 3Geschrieben am 18.11.25 von Sven Rahmann Blatt 4 ist online! Auf Blatt 3 waren leider kleine Fehler in den Aufgaben 03.5 und 03.6, aber niemand hat gemeckert. Vermutlich haben alle verstanden, was gemeint war. Zur Sicherheit ist jetzt das korrigierte Blatt 3 hochgeladen; in der Übung werden die "richtigen" Aufgaben besprochen. |
Übung 12.11. entfälltGeschrieben am 10.11.25 (letzte Änderung am 18.11.25) von Jens Zentgraf Wie bereits in der Übung angekündigt, findet diese Woche Mittwoch (12.11.) keine Übung statt. |
Übungsblatt 3 für 2 WochenGeschrieben am 04.11.25 (letzte Änderung am 04.11.25) von Sven Rahmann Wir haben Übungsblatt 3 hochgeladen. Es sind viele Aufgaben zum Alignment, aber auch 2 Wochen Zeit! Die Folien zum MSA werden so bald wie möglich nachgeliefert. Viele Aufgaben beziehen sich aber auf paarweises Alignment, so dass die Folien dafür nicht notwendig sind. |
Keine Office Hour am 31.10.Geschrieben am 30.10.25 (letzte Änderung am 04.11.25) von Johanna Schmitz Hallo, wie bereits im Tutorium angekündigt, findet morgen keine Office Hour statt. |
Materialen und AufgabenGeschrieben am 17.10.25 von Sven Rahmann In der Kategorie Informationen -> Materialien finden Sie jetzt Vorlesungsfolien für diese und nächste Woche, sowie das erste Aufgabenblatt, das bis MONTAG 27.10. bearbeitet werden soll. |
Tutorial und Office HourGeschrieben am 17.10.25 von Johanna Schmitz Hallo, |